Jake Sully et Neytiri sont maintenant les parents de quatre beaux enfants. Ils vivaient heureux et en paix sur Pandora jusqu'à ce que les hommes venus du ciel débarquent à nouveau sur leur terre pour en exploiter les ressources. Le Colonel Quaritch, qui a pu transposer son esprit dans le corps d'un Na'vi, a bien l'intention d'avoir la peau de Jake. Ainsi, pour protéger son peuple, Jake s'expatrie avec sa famille dans une autre tribu, vivant près de l'océan. Ils devront apprendre une impressionnante quantité de nouvelles informations afin de se fondre à leur nouvel environnement. Mais, même s'ils sont plus en sécurité loin de chez eux, la menace n'est jamais bien loin.